环境保护部8月4日正式公布了“三定方案”(定职能、定机构、定编制)，环保部设14个内设机构，增加了3个司局，分别为污染物排放总量控制司、环境监测司、宣传教育司。机关行政编制为311名，其中部长1名、副部长4名，司局级领导职数48名。同时，对重大经济政策、发展规划的环评，即规划环评，此次也列入到环保部的职责之内。 “三定”方案已获国务院批准，机构改革提上日程，环保部在职能、机构、编制上将得到加强。

环保部职责调整方面，水污染物排放许可证的审批和发放职责，将交给地方环境保护行政主管部门。同时，对于一直是热点的与其它部门职能交叉的问题，此次的“三定方案”中对“治水”方面的职责分工作出明确规定，环保部对水环境质量和水污染防治负责，水利部对水资源保护负责。

此外，水环境信息此次明确由环境保护部发布，并对信息的准确性、及时性负责。水利部发布水文水资源信息中涉及水环境质量的内容，应与环境保护部协商一致。